| | | | Pén | M | Coeff |
| 1. | Team 3L | Juniors B / tour automne | 1 | 22 | 0,045 |
| 2. | Grpm des 2 Thielles I | Juniors B / tour automne | 2 | 21 | 0,095 |
| 3. | FC Le Parc II | Juniors B / 2ème degré - tour printemps | 6 | 22 | 0,273 |
| 4. | Neuchâtel Xamax FCS | Juniors B / 1er degré - tour automne | 6 | 21 | 0,286 |
| FC Hauterive | Juniors B / tour automne | 6 | 21 | 0,286 |
| 6. | FC Le Landeron I | Juniors B / 2ème degré - tour printemps | 7 | 22 | 0,318 |
| 7. | FC Marin-Sports | Juniors B / tour automne | 11 | 22 | 0,500 |
| Neuchâtel Xamax FCS II | Juniors B / 2ème degré - tour printemps | 11 | 22 | 0,500 |
| 9. | Team Neuchâtel (Corcelles) | Juniors B / tour automne | 11 | 21 | 0,524 |
| 10. | Grpm Val-de-Travers (Couvet) I | Juniors B / 1er degré - tour printemps | 13 | 22 | 0,591 |
| 11. | FC Colombier | Juniors B / tour automne | 17 | 24 | 0,708 |
| 12. | Team Littoral (Boudry) | Juniors B / 2ème degré - tour printemps | 20 | 24 | 0,833 |
| 13. | Team La Chaux-de-Fonds (Deportivo) | Juniors B / tour printemps | 21 | 22 | 0,955 |
| 14. | FC Boudry II | Juniors B / 2ème degré - tour printemps | 24 | 22 | 1,091 |
| 15. | GrpM Le Parc | Juniors B / tour printemps | 23 | 21 | 1,095 |
| 16. | Team Béroche-Bevaix (Béroche) | Juniors B / tour printemps | 25 | 22 | 1,136 |
| 17. | FC Le Locle | Juniors B / tour automne | 36 | 22 | 1,636 |
| 18. | Grpm Val-de-Travers (Couvet) II | Juniors B / 2ème degré - tour printemps | 35 | 21 | 1,667 |
| 19. | FC Floria | Juniors B / tour automne | 45 | 23 | 1,957 |
| 20. | Team La Charrière (Floria) II | Juniors B / 2ème degré - tour printemps | 46 | 21 | 2,190 |